Présentation
Sur le plan personnel :
Je suis, conformément à ce que laisse deviner mon parcours professionnel, très interessé par les nouvelles technologies et leurs usages, en particulier dans les domaines de l'intelligence artificielle, du multimédia, de la robotique, et de l'énergie.
En plus de cela, j'aime grandement les jeux de société (avec une préférence pour les jeux de stratégie à rôles cachés ou non et les jeux de gestion) et la lecture (que ce soit de la BD, des manga, ou des romans).
J'aime aussi les jeux vidéos indépendants et le cinéma.
J'affectionne tout particulièrement la science-fiction.
J'ai eu l'occasion de beaucoup voyager pendant ma vie et j'adore ça.
Originaire de Béthune dans le Pas-de-Calais, j'ai eu l'occassion d'habiter à Lille, Metz, Strasbourg et finalement Clermont-Ferrand.
J'ai visité un bon nombre de pays européens, mais j'ai aussi eu la chance d'avoir un certain nombre d'expériences scolaires et professionnelles au Japon : à Yokohama, Fukuoka et Tsukuba, qui m'ont donné une affection toute particulière pour ce pays.
Je suis aussi un adepte de randonnées et des sports de raquette en tant qu'amateur.
Sur le plan professionnel :
Je suis un Docteur et Ingénieur en Vision par ordinateur s'étant initialement spécialisé dans les problématiques de recalage non-rigide et leur utilisation pour des applications liées à la réalité augmentée.
En plus de mon expertise en vision par ordinateur, j'ai aussi une forte expérience dans le domaine du deep learning et dans le domaine de l'intelligence artificielle en général, tant d'un point de vue théorique que technique.
Je suis actuellement en poste à Clermont-Ferrand, en tant que Data Science Technical Manager à SurgAR, entreprise developpant des dispositifs de réalité augmentée pour la chirurgie assistée par ordinateur.
J'y suppervise l'élaboration technique et la mise en place du pipeline de collecte et d'annotation de la donnée médicale des hôpitaux partenaires vers l'infrastructure cloud de l'entreprise. Je supervise également l'intégration logicielle des réseaux de neuronnes initialement prototypés par les membres de l'équipe de recherche.
J'offre aussi mon expertise en vision par ordinateur et en machine learning dans divers projets de recherches et pour le dévelopment de logiciels de réalité augmentée de l'entreprise.
Grâce à mon poste actuel, j'ai aussi des connaissances non négligeables du monde du développement de logiciels médicaux avec tout ce que cela implique d'un point de vu juridique et réglementaire.
Présentation
En équipe :
Je suis quelqu'un de très à l'aise en équipe.
J'aime faire partie et manager des équipes aux profils très variés et étant composées d'un vaste panel de personnalités différentes.
Il n'y a rien de mieux pour faciliter la prise de recul et pour avoir une meilleure vision, plus complète, d'un projet ou de n'importe quoi d'autre.
Je suis très à l'aise avec le côté scientifique et j'apprécie de faire le lien avec les autres équipes comme les équipes de developement et de communication.
J'aime vulgariser la connaissance scientifique et technique aux autres.
J'essaie toujours d'être patient et pédagogue.
Durant mon temps personnel, il n'est pas rare que je m'emporte et que cela engendre de longues discussions sur telle ou telle technologie, que ce soit sur son fonctionnement ou son histoire.
Je suis quelqu'un de très curieux, touche-à-tout et j'aime être pro-actif.
Lorsque je suis impliqué dans un projet, j'aime pouvoir m'y plonger pleinement.
J'aime les liens forts au sein d'une équipe et mes collègues deviennent très souvent des personnes que j'apprécie voir en dehors du travail.
Expériences
professionnelles
2021-2024 - SurgAR - Data Science Manager Clermont-Ferrand
Conception et supervision de la mise en place technique d'un pipeline de collecte et d'annotation de la donnée médicale provenant des hopitaux partenaires vers l'environnement cloud de l'entreprise.
Porteur de projet pour le developpement d'un logiciel d'anonymisation de vidéo chirurgicale et d'ajout de méta-données associées, developpé en C++/Qt.
Porteur de projet pour le developpement d'un logiciel d'accès à la donnée pour le personnel médical et les chercheurs ayant besoin de cette donnée, developpé en PHP/Symfony.
Mise en place de l'infrastructure Google Cloud Plateform associé au pipeline.
Participation au déploiement sur l'infrastructure Google Cloud Plateform, à la maintenance, et au monitoring d'une solution logicielle pour annoter la donnée médicale.
Conception d'un template python pour l'intégration des réseaux de neuronnes arificiels utilisés dans les différents dispositifs médicaux de l'entreprise, leur entraînement et leur évaluation.
Organisation de meetings scientifiques avec les différentes équipes de l'entreprise pour les sensibiliser aux problématiques associées au machine learning et pour leur vulgariser les différentes avancées dans ce milieu.
Écriture des procédures et des documents supports en lien avec l'activité Data science de l'entreprise afin de se conformer au standart ISO 13485.
Supervision de différents projets de recherche associés au développement de réseaux de neuronnes artificiels à utiliser dans les logiciels actuels et futurs de l'entreprise.
Détection et segmentation de structures anatomiques de l'utérus.
Classification des images identifiantes dans les vidéos chirurgicales.
Détection de lésions cancéreuses du péritoine dans les images coelioscopiques.
Vieille scientifique associée aux avancées dans le domaine de l'intelligence artificielle et son utilisation au sein de dispositifs médicaux.
Participation à la mise en place de la stratégie associée à la cybersécurité de l'entrerpise et de ses logiciels.
2020-2021 - SurgAR - Ingénieur R&D Clermont-Ferrand
Participation au developpement d'un logiciel de réalité augmentée pour la coelioscopie de l'utérus assistée par ordinateur.
Participation à l'écriture de la procédure et des documents supports en lien avec l'activité de Design et Developpement de l'entreprise afin de se conformer au standard ISO 13485.
2016-2020 - EnCoV et IHU Srasbourg - Doctorant Clermont-Ferrand et Strasbourg
Réalisation d'une thèse ayant pour sujet : Recalage déformable, jeux de données et protocoles d’évaluation pour la chirurgie mini-invasive abdominale augmentée.
Élaboration d'une solution de recalage déformable d'un modèle dans une configuration initiale à une scène où le modèle est vu dans une configuration déformée, en modélisant les propriétés mécaniques du modèle et son comportement.
Adaptation de la solution proposée pour son utilisation dans le cadre du recalage de modèle d'un abdomen de patient réalisé à partir de reconstruction 3D utilisant des images CT de celui-ci, à une scène dans laquelle la surface de la peau du patient est reconstruite en utilisant une méthode de Structure-from-Motion.
Participation à l'intégration de cette solution dans des prototypes de recherche utilisés par l'IHU Strasbourg.
Adaptation de la solution proposée, avec prise en compte de contraintes sur les collisions internes du modèle, dans le cadre du recalage de modèle de foie réalisé à partir de reconstruction 3D d'images CT de celui-ci, à une scène coelioscopique dans laquelle le foie est observé dans une configuration déformée.
Élaboration d'une solution de reconstruction de surface utilisant le Multi Vue Stéréo avec contraintes photométriques dans le cadre de la chirurgie coelioscopique.
Création de datasets et de protocoles d'évaluations associés aux différentes réalisations de la thèse.
2016 - Devatics - Ingénieur R&D Toulouse
Participation au developpement d'une plateforme en ligne d'analyse de comportements utilisateurs sur les pages web de sites de vente.
2015 - CNRS-AIST-JRL - Stagiaire en Vision par ordinateur Tsukuba
Stage de six mois dont l'objectif était d'utiliser d'une caméra RGB-D pour détecter et calculer les poses des surfaces réfléchissantes dans les images, et de les utiliser pour en déduire la position du robot humanoïde dans la scène sur lequel était montée la caméra et ainsi augmenter l'image finale en utilisant un avatar humain remplaçant le visuel du robot.
2014 - IRIT - Intern in Computer Vision Toulouse
Stage de deux mois dont l'objectif était de réaliser un système se basant sur la stéréophotométrie et permettant la reconstruction 3D d'un objet positionné devant un ordinateur en utilisant l'écran de celui-ci en tant que source lumineuse contrôlée.
Formation
2016-2020
Université Clermont Auvergne, Thèse en Vision par Ordinateur : Recalage déformable, jeux de données et protocoles d’évaluation pour la chirurgie mini-invasive abdominale augmentée, Clermont-Ferrand, France
2012-2015
INP ENSEEIHT, Diplôme d'ingénieur en informatique et mathématiques appliquées, spécialisation multimédia, Toulouse, France
2014-2015
Université Paul Sabatier, Master IACI : Master of Research in Artificial Intelligence, Toulouse, France
2009-2012
Lycée Fabert, École préparatoire MPSI/MP*, Metz, France
2008-2009
USTL, Première année de licence de biologie, Lille, France
2008
Lycée Carnot, Baccalauréat S, Bruay-Labuissière, France
Publications
Recalage déformable, jeux de données et protocoles d'évaluation pour la chirurgie mini-invasive abdominale augmentée
R Modrzejewski
Université Clermont Auvergne (Thèse de doctorat), 2020.
Light modelling and calibration in laparoscopy
R Modrzejewski, T Collins, A Hostettler, J Marescaux, A Bartoli
International journal of computer assisted radiology and surgery, 2020, vol. 15, no 5, p. 859-866.
An in vivo porcine dataset and evaluation methodology to measure soft-body laparoscopic liver registration accuracy with an extended algorithm that handles collisions
R Modrzejewski, T Collins, B Seeliger, A Bartoli, A Hostettler, J Marescaux
International journal of computer assisted radiology and surgery, 2019, vol. 14, no 7, p. 1237-1245.
Soft-body registration of pre-operative 3d models to intra-operative RGBD partial body scans
R Modrzejewski, T Collins, A Bartoli, A Hostettler, J Marescaux
Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention. Springer, Cham, 2018. p. 39-46.
Automatic verification of laparoscopic 3d reconstructions with stereo cross-validation
R Modrzejewski, T Collins, A Bartoli, A Hostettler, J Marescaux
Surgetica, 2017.
A full photometric and geometric model for attached webcam/matte screen devices
Y Quéau, R Modrzejewski, P Gurdjos, JD Durou
Signal Processing: Image Communication, 2016, vol. 40, p. 65-81.
Transformation d'un dispositif multimédia webcam-écran en un scanner 3D
Y Quéau, R Modrzejewski, P Gurdjos, JD Durou
COmpression et REprésentation des Signaux Audiovisuels (CORESA), 2014.